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/ Software Vault: The Sapphire Collection / Software Vault (Sapphire Collection) (Digital Impact).ISO / cdr16 / med9410d.zip / M94A0629.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-10-21  |  2KB  |  39 lines
  1.        Document 0629
  2.  DOCN  M94A0629
  3.  TI    Multiple proteins interact over the USF binding site in the human
  4.        immunodeficiency virus type 1 long terminal repeat.
  5.  DT    9412
  6.  AU    Tanskanen E; Deacon N; Churchill M; Doherty R; Macfarlane Burnet Centre
  7.        for Medical Research, Fairfield, Vic.
  8.  SO    Annu Conf Australas Soc HIV Med. 1993 Oct 28-30;5:69 (abstract no. FB4).
  9.        Unique Identifier : AIDSLINE ASHM5/94349026
  10.  AB    HIV-1 gene expression and viral replication are regulated by several
  11.        viral and cellular proteins, most commonly through binding sites within
  12.        the long terminal repeats (LTRs) of the viral genome. We have examined
  13.        binding of transcription factors over the region from nt -141 to nt -180
  14.        relative to transcription initiation using a novel approach in which a
  15.        series of five oligonucleotides were constructed with 13bp overlapping
  16.        altered sequences as compared to the wild-type HXB2 sequence. These
  17.        oligonucleotides were used in excess as competitors for protein binding
  18.        in electrophoretic mobility shift assays. Three of the five
  19.        oligonucleotides lost the ability to compete for proteins binding to the
  20.        wildtype sequence, localising nuclear factor binding to sequences
  21.        upstream of nt -159. This region contains the motif CACATG which has
  22.        previously been shown by DNAse footprinting to bind the transcription
  23.        factor USF (Giacca et al, Virology 1992; 186:133-147), however our data
  24.        indicate a more precise region of interaction. Examination of binding
  25.        from nuclear extracts of the lymphoblastoid cell lines CEM and MT-2 as
  26.        well as the epithelial HeLa cell line has shown that the interaction
  27.        involves more than one protein and that the different cell lines exhibit
  28.        different binding patterns over this region of the LTR. We have
  29.        calculated the approximate size of these DNA-protein complexes by UV
  30.        crosslinking and south-western analyses.
  31.  DE    Cell Line  DNA-Binding Proteins/*GENETICS  Gene Expression Regulation,
  32.        Viral/PHYSIOLOGY  Human  HIV-1/*GENETICS  Repetitive Sequences, Nucleic
  33.        Acid/*GENETICS  Transcription Factors/*GENETICS  Virus
  34.        Replication/*GENETICS  MEETING ABSTRACT
  35.  
  36.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  37.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  38.  
  39.